Les objectifs de la Société Française de Médecine Maritime sont:
- Promouvoir l'hygiène et la santé dans le milieu maritime
- Promouvoir et développer les connaissances médicales sur le milieu maritime, l’enseignement et les spécificités de l'exercice médical en milieu maritime
- Réunir les médecins, les chercheurs et tous professionnels de santé concernés ou intéressés par la médecine maritime
- Développer des relations avec les autres sociétés de médecine maritime au niveau international.