Les objectifs de la Société Française de Médecine Maritime sont:
Promouvoir l'hygiène et la santé dans le milieu maritime
Promouvoir et développer les connaissances médicales sur le milieu maritime, l’enseignement et les spécificités de l'exercice médical en milieu maritime
Réunir les médecins, les chercheurs et tous professionnels de santé concernés ou intéressés par la médecine maritime
Développer des relations avec les autres sociétés de médecine maritime au niveau international.